两个独立数据帧的距离矩阵

我想创建一个矩阵，其中包含一个数据帧的行与另一个数据帧的行的欧几里德距离。例如，假设我有以下数据框：

a <- c(1,2,3,4,5)
b <- c(5,4,3,2,1)
c <- c(5,4,1,2,3)
df1 <- data.frame(a,b,c)

a2 <- c(2,7,1,2,3)
b2 <- c(7,6,5,4,3)
c2 <- c(1,2,3,4,5)
df2 <- data.frame(a2,b2,c2)

我想创建一个矩阵，其中包含 df1 中每行与 df2 中行的距离。

所以matrix[2,1]应该是df1[2,]和df2[1,]之间的欧氏距离。 matrix[3,2] df[3,] 和 df2[2,] 之间的距离等。

有谁知道如何实现这一点？

也许你可以使用fields包：函数rdist可能会做你想做的事：

rdist ：欧几里德距离矩阵
描述：给定两组位置，计算所有配对之间的欧几里德距离矩阵。

> rdist(df1, df2)
     [,1]     [,2]     [,3]     [,4]     [,5]
[1,] 4.582576 6.782330 2.000000 1.732051 2.828427
[2,] 4.242641 5.744563 1.732051 0.000000 1.732051
[3,] 4.123106 5.099020 3.464102 3.316625 4.000000
[4,] 5.477226 5.000000 4.358899 3.464102 3.316625
[5,] 7.000000 5.477226 5.656854 4.358899 3.464102

类似的情况是pdist package

pdist：分区矩阵的观测值之间的距离
描述： 计算矩阵 X 的行与另一个矩阵 Y 的行之间的欧氏距离。

> pdist(df1, df2)
An object of class "pdist"
Slot "dist":
[1] 4.582576 6.782330 2.000000 1.732051 2.828427 4.242640 5.744563 1.732051
[9] 0.000000 1.732051 4.123106 5.099020 3.464102 3.316625 4.000000 5.477226
[17] 5.000000 4.358899 3.464102 3.316625 7.000000 5.477226 5.656854 4.358899
[25] 3.464102
attr(,"Csingle")
[1] TRUE

Slot "n":
[1] 5

Slot "p":
[1] 5

Slot ".S3Class":
[1] "pdist"

注意：如果您正在寻找行之间的欧几里得范数，您可能需要尝试：

a <- c(1,2,3,4,5)
b <- c(5,4,3,2,1)
c <- c(5,4,1,2,3)
df1 <- rbind(a, b, c)

a2 <- c(2,7,1,2,3)
b2 <- c(7,6,5,4,3)
c2 <- c(1,2,3,4,5)
df2 <- rbind(a2,b2,c2)

rdist(df1, df2)

这给出：

> rdist(df1, df2)
         [,1]     [,2]     [,3]
[1,] 6.164414 7.745967 0.000000
[2,] 5.099020 4.472136 6.324555
[3,] 4.242641 5.291503 5.656854