我正在使用 python 和 numpy/scipy 为文本处理应用程序执行正则表达式和词干提取。但我也想使用 R 的一些统计包。
将数据从 python 传递到 R 的最佳方法是什么? (然后回来?)
另外,我需要在某个时候将数组备份到磁盘,所以如果这是最好的解决方案,我愿意从 python 保存并加载 R。矩阵非常大(例如 100,000 x 10,000),因此使用稀疏矩阵也可能不错。
如果这是转发,我们深表歉意。我还没有找到任何东西可以将所有这些碎片组合在一起。
你已经研究过了吗RPy?它是 R 的 python 接口。我想这会让你省去数据处理的麻烦。
要备份 NumPy 数组,您可以使用pickle。由于保存大量数据时似乎会产生大量开销,因此最好使用 HDF 标准保存 NumPy 数组。这是一篇涵盖该内容的文章:http://www.shocksolution.com/2010/01/10/storing-large-numpy-arrays-on-disk-python-pickle-vs-hdf5adsf/
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