在 R 中运行 glmnet 包,出现错误“缺少 TRUE/FALSE 需要的值”,可能是由于缺少值?

2024-05-24

我正在尝试使用glmnet来自glmnet运行 LASSO 回归的包。

我正在使用以下命令:

library(glmnet)
glmnet(a,b,family="binomial",alpha=1)

我收到错误:

> Error in if (!all(o)) { : missing value where TRUE/FALSE needed

a是一个带有数值的矩阵。b是一个以因子为值的向量。

然而,b有一些缺失值。我怀疑这可能是导致错误的原因。但是,我没有看到排除的选项NAglmnet 文档中的 s。


Since glmnet不接受带有公式的完整数据框(因此没有 na.omit),但使用单独的响应和预测矩阵,您必须找到其中的哪些值b缺失,然后对预测矩阵进行子集化以排除这些行。

library(glmnet)

set.seed(123)
a <- matrix(rnorm(100*20),100,20)
b <- as.factor(sample(0:1,100,replace = TRUE))

b[10] <- NA

na_index <- is.na(b)
res <- glmnet(a[!na_index, ], b[!na_index], family = "binomial", alpha = 1)
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