S4 类 [（子集）带有附加参数的继承

这是一个扩展在 R 中的访问器函数中使用 callNextMethod() https://stackoverflow.com/q/24875284/2752888.

2017-03-25 更新：为了说明如何仅在加载方法时失败，但在构建的包中时不会失败，我创建了一个虚拟包：https://github.com/zkamvar/inheritest#readme https://github.com/zkamvar/inheritest#readme

基本问题：

我有一个类 bar 继承了另一个类 foo，并且它们都有 [ 方法的附加参数。 foo 的方法始终有效，但 bar 的方法在第一次使用后就会失败。

错误和回溯：

Error in callNextMethod(x, i, j, ..., drop): bad object found as method (class "function")

4: stop(gettextf("bad object found as method (class %s)",  dQuote(class(method))), 
   domain = NA)
3: callNextMethod(x, i, j, ..., drop) at #9
2: .local(x, i, j, ..., drop = drop)
1: BAR["x"]

更多细节：

我有一个包实现了一个类，该类依赖于另一个包中的类。当构建包时，一切正常，但是当我的包被简单加载时（使用devtools::load_all(".")），我得到下面的行为。

最小工作示例：

foo <- setClass("foo", representation(x = "numeric", y = "numeric"))
bar <- setClass("bar", representation(distance = "numeric"), contains = "foo")

setMethod(f = "[", signature = signature(x = "foo", i = "ANY", j = "ANY", drop = "ANY"), 
  definition = function(x, i, j, ..., foo = TRUE, drop = FALSE) {
    if (foo) 
      message("FOOOOOOO")
    if (i == "x") {
      return(x@x)
    } else {
      if (i == "y") {
        return(x@y)
      }
    }
  })
#> [1] "["

setMethod(f = "[", signature = signature(x = "bar", i = "ANY", j = "ANY", drop = "ANY"), 
  definition = function(x, i, j, ..., bar = TRUE, drop = FALSE) {
    if (bar) 
      message("BAAAAAAR")
    if (i == "distance") {
      return(x@distance)
    } else {
      callNextMethod(x, i, j, ..., drop)
    }
  })
#> [1] "["

FOO <- new("foo", x = 1, y = 4)
BAR <- new("bar", x = 1, y = 4, distance = 3)
FOO["x"]
#> FOOOOOOO
#> [1] 1
BAR["x"]
#> BAAAAAAR
#> FOOOOOOO
#> [1] 1
FOO["x"]
#> FOOOOOOO
#> [1] 1
BAR["distance"]
#> BAAAAAAR
#> [1] 3
BAR["x"]  # fails
#> BAAAAAAR
#> Error in callNextMethod(x, i, j, ..., drop): bad object found as method (class "function")
BAR["x", foo = FALSE]
#> BAAAAAAR
#> [1] 1

注意：当我通过这个时reprex https://CRAN.R-project.org/package=reprex，对 BAR 的第一次和最后一次调用也导致了错误，但我正在展示我在交互式会话中所经历的情况。我使用的是 R 版本 3.3.3

这是因为callNextMethod()不够聪明，无法处理带有增强形式的原语方法。我已经修复了它，并将很快提交到主干。