我有一些具有以下声明的 C 代码：

int myfunc(int m, int n, const double **a, double **b, double *c);

So a是一个常量二维数组，b是一个二维数组，并且c是一个一维数组，全部动态分配。b and c在传递给之前不需要特别指定任何内容myfunc，应该理解为输出信息。出于这个问题的目的，我无权更改声明myfunc.

问题一：如何转换给定的 numpy 数组a_np到一个数组中a具有此 C 函数所需的格式，以便我可以在 Cython 中调用此 C 函数a?

问题2：声明是否为b and c下面是正确的，还是它们需要采用其他格式才能让 C 函数将它们理解为 2D 和 1D 数组（分别）？

我的尝试：

myfile.pxd

cdef extern from "myfile.h":
    int myfunc(int p, int q, const double **a, double **b, double *c)

mytest.pyx

cimport cython
cimport myfile
import numpy as np
cimport numpy as np

p = 3
q = 4
cdef:
    double** a = np.random.random([p,q])
    double** b
    double* c

myfile.myfunc(p, q, a, b, c)

然后在 iPython 中我运行

import pyximport; pyximport.install()
import mytest

与定义相关的线a给我错误消息Cannot convert Python object to 'double **'。我没有收到任何有关的错误消息b or c，但由于我此时无法运行 C 函数，所以我不确定b and c编写正确（即，以使得 C 函数能够分别输出 2D 和 1D 数组的方式）。

其他尝试：我也尝试过遵循解决方案here https://stackoverflow.com/a/25972568/2944305，但这不适用于我在中的双星号类型的数组myfunc宣言。解决方案here https://stackoverflow.com/a/20938498/2944305不适用于我的任务，因为我无法更改的声明myfunc.

在 cython 中创建辅助数组

为了得到一个double**从 numpy 数组，您可以在 *.pyx 文件中创建指针辅助数组。此外，您必须确保 numpy 数组具有正确的内存布局。 （这可能涉及创建副本）

Fortran顺序

如果您的 C 函数需要 Fortran 顺序（一个列表中的所有 x 坐标，另一个列表中的所有 y 坐标，第三个列表中的所有 z 坐标，如果您的数组 a 对应于 3D 空间中的点列表）

N,M = a.shape
# Make sure the array a has the correct memory layout (here F-order)
cdef np.ndarray[double, ndim=2, mode="fortran"] a_cython =
                         np.asarray(a, dtype = float, order="F")
#Create our helper array
cdef double** point_to_a = <double **>malloc(M * sizeof(double*))
if not point_to_a: raise MemoryError
try:
    #Fillup the array with pointers
    for i in range(M): 
        point_to_a[i] = &a_cython[0, i]
    # Call the C function that expects a double**
    myfunc(... &point_to_a[0], ...)
finally:
    free(point_to_a)

C-order

如果您的 C 函数需要 C 顺序（[x1,y1,z1] 是第一个列表，[x2,y2,z2] 是 3D 点列表的第二个列表）：

N,M = a.shape
# Make sure the array a has the correct memory layout (here C-order)
cdef np.ndarray[double, ndim=2, mode="c"] a_cython =
                         np.asarray(a, dtype = float, order="C")
#Create our helper array
cdef double** point_to_a = <double **>malloc(N * sizeof(double*))
if not point_to_a: raise MemoryError
try:
    for i in range(N): 
        point_to_a[i] = &a_cython[i, 0]
    # Call the C function that expects a double**
    myfunc(... &point_to_a[0], ...)
finally:
    free(point_to_a)