在 R igraph 中正确着色顶点

2024-02-22

我正在使用 igraph 给顶点着色

我有两个 CSV 文件答案和图表拓扑。

答案:(这表明玩家 K 和 N 回答正确)

  Player Q1_I1
1      k     1
2      l     0
3      n     1
4      m     0

拓扑:(表示谁与谁相连)

  Node.1 Node.2
1      k      l
2      l      k
3      l      m
4      m      l
5      l      n
6      n      l
7      n      k
8      k      n

我想使用 IGraph 包构建一个图,并根据顶点的正确性将其着色为不同的颜色。

这就是我能够实现的目标:

# reads answers and creates a graph from topology
answers <- read.csv("answers2.csv",header=T)
data<-read.csv('edges2.csv')
data<-graph.data.frame(data1, directed=FALSE)
g<-simplify(data)

# goes through vertices and colors them in different color, depending on correctness. 
# 2 means second column (First one is the players name)
V(g)$color <- ifelse(answers[V(g), 2] == 1, "blue", "red")
plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold, vertex.color=V(g)$color)  

The problem is that in my output the colors are wrong:enter image description here

这里M和K被标记为正确,而应该是N和K。 我认为问题是因为我没有指定 Node 应该与 Player 相关,并且我尝试实现这一点,但没有成功。

有什么想法如何实现这一目标吗?


最简单的方法是创建包含所有元数据的图表,然后 igraph 处理其余的事情。例如。

library(igraph)

answers <- read.table(textConnection(
   "  Player Q1_I1                                                             
    1      k     1                                                             
    2      l     0                                                             
    3      n     1                                                             
    4      m     0                                                             
"))

topology <- read.table(textConnection(
   "  Node.1 Node.2                                                            
    1      k      l                                                            
    2      l      k                                                            
    3      l      m                                                            
    4      m      l                                                            
    5      l      n                                                            
    6      n      l                                                            
    7      n      k                                                            
    8      k      n                                                            
 "))

g2 <- graph.data.frame(topology, vertices=answers, directed=FALSE)
g <- simplify(g2)
V(g)$color <- ifelse(V(g)$Q1_I1 == 1, "lightblue", "orange")

plot(g)

但是,实际上,如果您不包含数据表中两个方向的每条边,那么您甚至不需要调用简化。

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