是否可以使用 tbl_svysummary() 创建分层表(tbl_strata)?

2024-02-16

我对调查数据和 gtsumarry 包还很陌生。 我尝试使用以下代码从调查数据创建分层表,但收到错误“错误:问题mutate() input tbl".

# Reading the subset of the data

fileUrl <- "https://raw.github.com/Shadi-Sadie/Paper-1-Cancer-Screening-and-Immigrants/master/Cleaned%20Data/subset.csv"
SData<-read.csv( fileUrl , header = TRUE, sep ="," )

# Setting the weight 

options( "survey.replicates.mse" = TRUE)
svy <- svrepdesign(repweights = "PWGTP[0-9]+",
                   weights = ~PWGTP,
                   combined.weights = TRUE,
                   type = "JK1",
                   scale = 4/80, rscales = rep(1, 80),
                   data = SData)

# creating the table

SData %>%
        select(CITG, HICOV, ESRG , EXPANSION) %>%
        tbl_strata(
                strata = CITG,
                .tbl_fun =
                        ~ .x %>% tbl_svysummary(
                                by = EXPANSION,
                                include = c(CITG, HICOV, ESRG , EXPANSION),
                                label = list(CITG ~ "Nativity",
                                             HICOV~ "Any health insurance",
                                             ESRG~ "Employment",
                                             EXPANSION ~ "Expansion" )
                        )
        )

如果可以使用的话tbl_svysummary()tbl_strata()谁能告诉我我哪里做错了?


感谢您更新可复制的帖子。我做了以下更改:

  1. 您将数据帧传递给tbl_strata()并需要更新为调查设计对象。
  2. 分层变量不应列在tbl_summary(include=)争论。

快乐编程!

library(gtsummary)
packageVersion("gtsummary")
#> [1] '1.6.0'

fileUrl <- "https://raw.github.com/Shadi-Sadie/Paper-1-Cancer-Screening-and-Immigrants/master/Cleaned%20Data/subset.csv"
SData <- read.csv(fileUrl, header = TRUE, sep = ",")

# Setting the weight
options("survey.replicates.mse" = TRUE)
svy <- survey::svrepdesign(
  repweights = "PWGTP[0-9]+",
  weights = ~PWGTP,
  combined.weights = TRUE,
  type = "JK1",
  scale = 4 / 80, rscales = rep(1, 80),
  data = SData
)

# creating the table
tbl <-
  svy %>%
  tbl_strata(
    strata = CITG,
    .tbl_fun =
      ~ .x %>% tbl_svysummary(
        by = EXPANSION,
        include = c(HICOV, ESRG, EXPANSION),
        label = list(
          HICOV = "Any health insurance",
          ESRG = "Employment",
          EXPANSION = "Expansion"
        )
      )
  )

enter image description here Created on 2022-05-01 by the reprex package https://reprex.tidyverse.org (v2.0.1)

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