在 R 中使用 MICE 时内存不足

2024-01-20

我正在尝试使用 MICE 包在 R 中创建多个插补,但内存不足。 这是我收到的错误消息:

Error: cannot allocate vector of size 219 Kb
In addition: Warning messages:
1: In unlist(vlist, recursive = FALSE, use.names = FALSE) :
  Reached total allocation of 6500Mb: see help(memory.size)
2: In unlist(vlist, recursive = FALSE, use.names = FALSE) :
  Reached total allocation of 6500Mb: see help(memory.size)  

我使用 64 位 R 和 Windows 7 和 8 Gb 内存。我尝试增加物理内存,允许使用的内存大小 R 分别为 8 Gb 和 6.5 Gb,但仍然不起作用。目前,我正在尝试对包含 27 000 行和 17 列的数据集进行插补,但我希望使用包含 1 600 000 行和 17 列的更大数据。

有人能帮我吗?会深深感激的。

/Jesper


要检查内存的当前限制(以 Mb 为单位),请尝试

memory.limit(size = NA)

要最大化它(相对于您的 8Gb RAM)尝试

memory.limit(size = 8190)

另外,别忘了打电话gc()在运行任何内存密集型功能之前多次。如果仍然不起作用,请确保关闭任何其他活动的应用程序,重新启动 R 并执行上述操作。如果这不能解决您的问题,请尝试利用其他软件包的功能,例如ff, snow, and bigmemory.

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