R - 缓慢地工作 lapply 对有序因子进行排序

2024-01-04

根据问题创建语料库和 DTM 的更有效方法 https://stackoverflow.com/questions/25330753/more-efficient-means-of-creating-a-corpus-and-dtm/25333858我已经准备了自己的方法,用于从大型语料库构建术语文档矩阵,(我希望)不需要术语 x 文档内存。

sparseTDM <- function(vc){
  id = unlist(lapply(vc, function(x){x$meta$id}))
  content = unlist(lapply(vc, function(x){x$content}))
  out = strsplit(content, "\\s", perl = T)
  names(out) = id
  lev.terms = sort(unique(unlist(out)))
  lev.docs = id

  v1 = lapply(
    out,
    function(x, lev) {
      sort(as.integer(factor(x, levels = lev, ordered = TRUE)))
    },
    lev = lev.terms
  )

  v2 = lapply(
    seq_along(v1),
    function(i, x, n){
      rep(i,length(x[[i]]))
    },
    x = v1,
    n = names(v1)
  )

  stm = data.frame(i = unlist(v1), j = unlist(v2)) %>%
    group_by(i, j) %>%
    tally() %>%
    ungroup()

  tmp = simple_triplet_matrix(
    i = stm$i,
    j = stm$j,
    v = stm$n,
    nrow = length(lev.terms),
    ncol = length(lev.docs),
    dimnames = list(Terms = lev.terms, Docs = lev.docs)
  )

  as.TermDocumentMatrix(tmp, weighting = weightTf)
}

它在计算时减慢v1。它运行了30分钟,我把它停了下来。

我准备了一个小例子:

b = paste0("string", 1:200000)
a = sample(b,80)
microbenchmark(
  lapply(
    list(a=a),
    function(x, lev) {
      sort(as.integer(factor(x, levels = lev, ordered = TRUE)))
    },
    lev = b
  )
)

结果是:

Unit: milliseconds
expr      min       lq      mean   median       uq      max neval
...  25.80961 28.79981  31.59974 30.79836 33.02461 98.02512   100

Id 和 content 有 126522 个元素,Lev.terms 有 155591 个元素,所以看来我已经过早停止处理了。由于最终我将处理约 6M 的文档,我需要问...有什么方法可以加快这段代码的速度吗?


现在我已经加快了更换速度

sort(as.integer(factor(x, levels = lev, ordered = TRUE)))

with

ind = which(lev %in% x)
cnt = as.integer(factor(x, levels = lev[ind], ordered = TRUE))
sort(ind[cnt])

现在时间安排是:

expr      min       lq     mean   median       uq      max neval
...  5.248479 6.202161 6.892609 6.501382 7.313061 10.17205   100
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