R 包中的私有 Bitbucket 包依赖项

2023-12-06

Summary

创建包时,我可以在中列出 CRAN 依赖项Depends列出在DESCRIPTION file. 本文档概述了如何列出 Bitbucket 依赖项,例如。Remotes: bitbucket::sulab/mygene.r@default.

但是,当需要身份验证才能访问存储库时,我不知道如何执行此操作。

Attempt

我尝试将以下代码放入主程序中packagename.R文件。函数内容作为独立脚本顶部的片段可以正常工作:

.onLoad <- function(libname, pkgname) {
  otherPackageVersion <- "1.0"
  if (suppressWarnings(suppressPackageStartupMessages(require("otherPackageName", quietly = TRUE, character.only = TRUE)))) {
    if (installed.packages()[installed.packages()[,"Package"] == "otherPackageName", "Version"] != otherPackageVersion) {
      remove.packages("otherPackage")
      devtools::install_bitbucket(sprintf("bitbucketUser/otherPackageName@%s", otherPackageVersion), auth_token = Sys.getenv("BITBUCKET_PAT"))
    }
  } else {
    devtools::install_bitbucket(sprintf("bitbucketUser/otherPackageName@%s", otherPackageVersion), auth_token = Sys.getenv("BITBUCKET_PAT"))
  }
}

但 R CMD 检查失败,表示挂起一段时间后无法加载:

checking whether package ‘packageName’ can be installed ... ERROR
Installation failed.

更多细节

的版本devtools我已经加载的是1.12.0.9000 (see 这个 Github 线程)我安装使用devtools::install_github("hadley/devtools#1220")。这允许我使用以下命令安装私有 Bitbucket R 软件包应用程序密码存储在环境变量中,而不是以明文形式提交我的用户名/密码。


这将不可能,直到this(使用 Bitbucket PAT 的拉取请求)被合并到 devtools 包中。

编辑:多年后检查这一点,它是使用 BitBucket 按当前版本的 devtools (2.4.3) 为我排序的应用程序密码具有存储库读/写和项目读/写权限。

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