我目前有一个英国的形状文件，并绘制了英国不同地区的物种数量。到目前为止，我刚刚绘制了 3 个物种种群水平，并将它们着色为红色=高、橙色=中、绿色=低。但我想做的是绘制一个渐变图，而不是仅受 3 种颜色的限制。 到目前为止，我有一个名为“计数”的表，其中将区域作为列名称，然后是下面每个区域的物种计数。我的最低计数为 0，最高计数约为 2500，并且计数中的区域与我的 shapefile 中的区域相匹配。我有一个函数可以根据您自己输入的级别确定高、中、低
High<-colnames(Count)[which(Count>'input value here')]
然后将它们绘制到 shapefile 上，如下所示：
plot(ukmap[(ukmap$Region %in% High),],col='red',add=T)
不幸的是，我无法真正安装任何软件包，我正在考虑使用 colorRamp，但我不太确定该怎么做？
编辑：我的数据看起来像这样
Wales Midlands North Scotland South East South West
1 551 32 124 1 49 28
3 23 99 291 152 164 107
4 1 7 17 11 21 14
7 192 32 12 0 1 9
9 98 97 5 1 21 0
第一列只是一个代表物种的数字，目前我有一个函数可以将计数绘制到英国形状文件上，但基于高、中和低的边界。上面的数据没有附加到我的形状文件中。然后，我循环遍历数据集的每一行（物种），并为每一行（物种）绘制一个新地图。
好吧，我咬一下。我不会使用基础 R 因为plot对我来说太难理解了，所以我们将使用ggplot2.
# UK shapefile found via http://www.gadm.org/download
uk.url <- "http://www.filefactory.com/file/s3dz3jt3vr/n/GBR_adm_zip"
# replace following with your working directory - no trailing slash
work.dir <- "C:/Temp/r.temp/gb_map"
# the full file path for storing file
file.loc <- paste0(work.dir, "/uk.zip")
download.file (uk.url, destfile = file.loc, mode = "wb")
unzip(file.loc, exdir = work.dir)
# open the shapefile
require(rgdal)
require(ggplot2)
uk <- readOGR(work.dir, layer = "GBR_adm2")
# use the NAME_2 field (representing counties) to create data frame
uk.map <- fortify(uk, region = "NAME_2")
# create fake count data...
uk.map$count <- round(runif(nrow(uk.map), 0, 2500), 0)
# quick visual check
ggplot(uk.map, aes(x = long, y = lat, group = group, fill = count)) +
geom_polygon(colour = "black", size = 0.5, aes(group = group)) +
theme()
这会生成以下输出，可能与您需要的类似。
请注意，在这种情况下我们没有明确指定梯度 - 我们只是将其保留为ggplot。如果您希望指定这些详细信息，这是可能的，但会涉及更多。如果您沿着这条路线走，您应该在中创建另一列uk.map使用以下方法将每个计数分配到（例如）10 个 bin 之一cut功能。这uk.map数据框如下所示：
> str(uk.map)
'data.frame': 427339 obs. of 8 variables:
$ long : num -2.05 -2.05 -2.05 -2.05 -2.05 ...
$ lat : num 57.2 57.2 57.2 57.2 57.2 ...
$ order: int 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ hole : logi FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE ...
$ piece: Factor w/ 234 levels "1","2","3","4",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ group: Factor w/ 1136 levels "Aberdeen.1","Aberdeenshire.1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ id : chr "Aberdeen" "Aberdeen" "Aberdeen" "Aberdeen" ...
$ count: num 1549 1375 433 427 1282 ...
>