如何将 R Markdown 转换为 HTML？即，“Knit HTML”在 Rstudio 0.96 中做什么？

在 Rstudio 0.96 中的 R Markdown 文件上按“Knit HTML”时会运行哪些命令？

我的动机是，当我在另一个文本编辑环境中时，我可能想运行相同的命令，或者我可能想将命令组合到更大的文本编辑器中。makefile.

基本脚本

所以现在R markdown软件包已发布，这里是一些将 Knit 的功能复制到 Html 的代码。

require(knitr) # required for knitting from rmd to md
require(markdown) # required for md to html 
knit('test.rmd', 'test.md') # creates md file
markdownToHTML('test.md', 'test.html') # creates html file
browseURL(paste('file://', file.path(getwd(),'test.html'), sep='')) # open file in browser 

where test.rmd是 R markdown 文件的名称。 请注意，我对 browserURL 行不是 100% 有信心（因此我的问题是关于在网络浏览器中打开文件).

markdownToHTML 选项

好的一点是markdownToHTML是在如何创建 HTML 方面有很多选项（请参阅?markdownHTMLOptions）。例如，如果您只想要一个没有所有标头信息的代码片段，您可以编写：

markdownToHTML('test.md', 'test.html', options='fragment_only')

或者，如果您不喜欢硬换行（即，当 Markdown 源中有单个手动换行符时插入换行符），您可以省略 'hard_wrap' 选项。

# The default options are 'hard_wrap', 'use_xhtml', 
#      'smartypants', and 'base64_images'.
markdownToHTML('test.md', 'test.html', 
       options=c('use_xhtml', 'base64_images'))

Makefile

这也可以全部添加到 makefile 中，也许使用Rscript -e (e.g., 像这样的东西）。这是我整理的一个基本示例 makefile，其中test表示调用rmd文件test.rmd.

RMDFILE=test

html :
    Rscript -e "require(knitr); require(markdown); knit('$(RMDFILE).rmd', '$(RMDFILE).md'); markdownToHTML('$(RMDFILE).md', '$(RMDFILE).html', options=c('use_xhtml', 'base64_images')); browseURL(paste('file://', file.path(getwd(),'$(RMDFILE).html'), sep=''))"

makefile 使用我喜欢的降价选项：即options=c('use_xhtml', 'base64_images')