如何增加ofstream的缓冲区大小

2024-05-16

我想增加 C++ 程序的缓冲区大小,以便它不会过于频繁地写入。默认缓冲区是 8192 字节,我尝试使用 pubsetbuf 将其增加到 200K。

原始代码

ofstream fq(fastq1.cstr(), ios::out); // fastq1 is a file
BamReader reader;  // BamReader parses and reads in "bamFile" below
reader.Open(bamFile);
while (reader.GetNext()) {
    fq << bam.Name << "\n";
    fq << bam.seq << "\n";
    fq << bam.qual << "\n";
}

修改的

ofstream fq(fastq1.cstr(), ios::out); // fastq1 is a file with certain format
// setting buffer size to 200K
int buf_size = 204800;
char buf[buf_size];
fq.rdbuf()->pubsetbuf(buf, buf_size);

BamReader reader;  // BamReader parses and reads in "bamFile" below
reader.Open(bamFile);
while (reader.GetNext()) {
    fq << bam.Name << "\n";
    fq << bam.seq << "\n";
    fq << bam.qual << "\n";
}

然而,从 strace 输出来看,更改前后似乎没有什么区别。

writev(3, [{"\n@C3A7DACXX140502:3:1209:20544:1"..., 8186}, {"ACCTCCTCCTGCTTTCACCTATCCCGCTTCAC"..., 76}], 2) = 8262
writev(4, [{"\n@C3A7DACXX140502:3:1209:20544:1"..., 8186}, {"GATCCTCGTCAGTCCTGAAGGAGTGTCAGCTT"..., 76}], 2) = 8262
writev(3, [{"\n+\nBA@CDEEEDEFEDBBDCDBDBCDCB@DDB"..., 8148}, {"??>ABEEECADDBBABBDCEBDCDCBECDBC@"..., 76}], 2) = 8224
writev(4, [{"\n+\n>>;ABCD@BEDFCDCDECCECCE?DADCE"..., 8148}, {">>;ABABBDDECEDECECCCECBBECCDDDFD"..., 76}], 2) = 8224
writev(3, [{"\n@C3A7DACXX140502:3:1209:20618:6"..., 8184}, {"TTGGAAGGCCAGGTCCAGTAACCGGCCCCATT"..., 76}], 2) = 8260
writev(4, [{"\n@C3A7DACXX140502:3:1209:20618:6"..., 8184}, {"ATTAGTAATTTCAGTGCCTCCTCCATCTTTAG"..., 76}], 2) = 8260
writev(3, [{"\n+\n?@>CCDFEEDDDCBDBDEBBCDB@CDBBB"..., 8148}, {"B@<DDDDFCEDEBBDDBDBDC@EBBECDDCEC"..., 76}], 2) = 8224
writev(4, [{"\n+\n>=;?C@?CBCCEDEAEDCDDBDDBDCDEB"..., 8148}, {">><A@BED@DDBDECBCBECCECDBDCDBEED"..., 76}], 2) = 8224
writev(3, [{"\n@C3A7DACXX140502:3:1209:20684:3"..., 8180}, {"ACCCAAATGAGATCTGTGTGCCAATGTCAGTG"..., 76}], 2) = 8256
writev(4, [{"\n@C3A7DACXX140502:3:1209:20684:3"..., 8180}, {"TCATCTGTGAACTCCACCAAGTTTTGTGCCTC"..., 76}], 2) = 8256
writev(3, [{"\n+\nBA@CCDDDFDFBBDDEBECEDBCCCEBDC"..., 8147}, {"BA?AEEEEECFDBDBBCCECCC?DBBDBDBEA"..., 76}], 2) = 8223
writev(4, [{"\n+\n>?=@BCE@EDDEEDBDDBDCEBBBBEBED"..., 8147}, {">?<ABCBBBEDECBCCDBDCDDECBBEBDDDD"..., 76}], 2) = 8223

我做错了什么?


None

本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

如何增加ofstream的缓冲区大小 的相关文章

  • WPF DataGrid 多选

    我读过几篇关于这个主题的文章 但很多都是来自 VS 或框架的早期版本 我想做的是从 dataGrid 中选择多行并将这些行返回到绑定的可观察集合中 我尝试创建一个属性 类型 并将其添加到可观察集合中 它适用于单个记录 但代码永远不会触发多个
  • 在模板类中声明模板友元类时出现编译器错误

    我一直在尝试实现我自己的链表类以用于教学目的 我在迭代器声明中指定了 List 类作为友元 但它似乎无法编译 这些是我使用过的 3 个类的接口 Node h define null Node
  • 没有特殊字符的密码验证器

    我是 RegEx 的新手 已经进行了大量搜索 但没有找到任何具体内容 我正在编写一个验证密码字符串的正则表达式 可接受的字符串必须至少具有 4 种字符类型中的 3 种 数字 小写字母 大写字母 特殊字符 我对包含有一个想法 也就是说 如果这
  • 根据属性的类型使用文本框或复选框

    如果我有这样的结构 public class Parent public string Name get set public List
  • 随着时间的推移,添加到 List 变得非常慢

    我正在解析一个大约有 1000 行的 html 表 我从一个字符串中添加 10 个字符串 td 每行到一个list td
  • 如何在 C# 中打开 Internet Explorer 属性窗口

    我正在开发一个 Windows 应用程序 我必须向用户提供一种通过打开 IE 设置窗口来更改代理设置的方法 Google Chrome 使用相同的方法 当您尝试更改 Chrome 中的代理设置时 它将打开 Internet Explorer
  • 为什么 GCC 不允许我创建“内联静态 std::stringstream”?

    我将直接前往 MCVE include
  • 如何使从 C# 调用的 C(P/invoke)代码“线程安全”

    我有一些简单的 C 代码 它使用单个全局变量 显然这不是线程安全的 所以当我使用 P invoke 从 C 中的多个线程调用它时 事情就搞砸了 如何为每个线程单独导入此函数 或使其线程安全 我尝试声明变量 declspec thread 但
  • 方程“a + bx = c + dy”的积分解

    在等式中a bx c dy 所有变量都是整数 a b c and d是已知的 我如何找到整体解决方案x and y 如果我的想法是正确的 将会有无限多个解 由最小公倍数分隔b and d 但我只需要一个解决方案 我可以计算其余的 这是一个例
  • 人脸 API DetectAsync 错误

    我想创建一个简单的程序来使用 Microsoft Azure Face API 和 Visual Studio 2015 检测人脸 遵循 https social technet microsoft com wiki contents ar
  • ASP.NET Core 3.1登录后如何获取用户信息

    我试图在登录 ASP NET Core 3 1 后获取用户信息 如姓名 电子邮件 id 等信息 这是我在登录操作中的代码 var claims new List
  • 如何定义一个可结构化绑定的对象的概念?

    我想定义一个concept可以检测类型是否T can be 结构化绑定 or not template
  • C# xml序列化必填字段

    我需要将一些字段标记为需要写入 XML 文件 但没有成功 我有一个包含约 30 个属性的配置类 这就是为什么我不能像这样封装所有属性 public string SomeProp get return someProp set if som
  • C# 动态/expando 对象的深度/嵌套/递归合并

    我需要在 C 中 合并 2 个动态对象 我在 stackexchange 上找到的所有内容仅涵盖非递归合并 但我正在寻找能够进行递归或深度合并的东西 非常类似于jQuery 的 extend obj1 obj2 http api jquer
  • 为什么使用小于 32 位的整数?

    我总是喜欢使用最小尺寸的变量 这样效果就很好 但是如果我使用短字节整数而不是整数 并且内存是 32 位字可寻址 这真的会给我带来好处吗 编译器是否会做一些事情来增强内存使用 对于局部变量 它可能没有多大意义 但是在具有数千甚至数百万项的结构
  • 如何在 Linq to SQL 中使用distinct 和 group by

    我正在尝试将以下 sql 转换为 Linq 2 SQL select groupId count distinct userId from processroundissueinstance group by groupId 这是我的代码
  • 使用特定参数从 SQL 数据库填充组合框

    我在使用参数从 sql server 获取特定值时遇到问题 任何人都可以解释一下为什么它在 winfom 上工作但在 wpf 上不起作用以及我如何修复它 我的代码 private void UpdateItems COMBOBOX1 Ite
  • MySQL Connector C/C API - 使用特殊字符进行查询

    我是一个 C 程序 我有一个接受域名参数的函数 void db domains query char name 使用 mysql query 我测试数据库中是否存在域名 如果不是这种情况 我插入新域名 char query 400 spri
  • Mono 应用程序在非阻塞套接字发送时冻结

    我在 debian 9 上的 mono 下运行一个服务器应用程序 大约有 1000 2000 个客户端连接 并且应用程序经常冻结 CPU 使用率达到 100 我执行 kill QUIT pid 来获取线程堆栈转储 但它总是卡在这个位置
  • 从 mvc 控制器使用 Web api 控制器操作

    我有两个控制器 一个mvc控制器和一个api控制器 它们都在同一个项目中 HomeController Controller DataController ApiController 如果我想从 HomeController 中使用 Dat

随机推荐

  • PostgreSQL - 根据另一个单元格值设置默认单元格值

    如果我有一个专栏说column a任何给定值 我想要另一列column b有一个default value根据 的值column a 换句话说 if column a peter then column b default value do
  • Flask 应用程序路由中的多个参数

    烧瓶怎么写app route如果我在 URL 调用中有多个参数 这是我从 AJax 调用的 URL http 0 0 0 0 8888 createcm summary VVV change Feauure 我试图写我的烧瓶app rout
  • 无需越狱即可检测iOS9上哪个应用程序处于前台

    我正在尝试记录用户在 iOS9 上的个人应用程序使用情况 我宁愿它不会使用越狱有限的解决方案 不言自明 在越狱手机上执行此应用程序的变体应该不难 https www andyibanez com create mobilesubstrate
  • 在 java 中运行外部应用程序但不要等待它完成

    我正在用java编写一个应用程序 允许我运行其他应用程序 为此 我使用了 Process 类对象 但当我这样做时 应用程序会等待进程结束 然后再退出 有没有办法在 Java 中运行外部应用程序 但不等待它完成 public static v
  • 检索 geodjango 多边形对象的边界框

    如何在 geodjango 中获取 MultiPolygon 对象的边界框 在 API 中找不到任何内容http geodjango org docs geos html http geodjango org docs geos html
  • 检测IE8兼容模式[重复]

    这个问题在这里已经有答案了 可能的重复 区分IE7浏览器和IE7兼容模式浏览器 https stackoverflow com questions 10213639 differentiate ie7 browser and browser
  • 为现有模块创建 d.ts 文件

    我正在尝试创建一个d ts文件为React 静态容器 https github com reactjs react static container图书馆 NPM 中安装的库如下所示 var React require react var
  • 如何在 Elastic Beanstalk 上添加 PATH

    我想将 PATH 添加到包上eb deploy 软件包安装到 var www html vendor bin 可以通过SSH手动添加 但是如何使用配置文件添加PATH 我有这样的配置文件 ebextensions ec2 config 01
  • 使用seaborn绘制简单线图

    我正在尝试使用seaborn python 绘制ROC曲线 对于 matplotlib 我只需使用该函数plot plt plot one minus specificity sensitivity bs where one minus s
  • 如何在 AutoFac 上使用内部构造函数解析公共类

    我有这个类要在单元测试中实例化 public class Customer internal Customer Guid id initialize property 如果我使用另一个 单元测试 程序集实例化测试类new Customer
  • 中有样式表 吗?

    在内部链接 CSS 文件是一个坏主意吗 body 我读过 如果浏览器在外部找到另一个 CSS 文件 则它会被迫重新开始 CSS 渲染 head 只是因为它可能需要将样式应用于已经渲染的元素 另外 我认为 HTML 无法正确验证 我需要确认这
  • 以 2 为底的矩阵对数

    Logm 取矩阵对数 并且log2 取矩阵每个元素以 2 为底的对数 我正在尝试计算冯 诺依曼熵 它涉及以 2 为底的矩阵对数 我该怎么做呢 如果将 以 2 为底 的矩阵指数定义为B expm log 2 A 或者如果您类似地通过特征分解直
  • 检测 TextBox 中的 Tab 键按下

    I am trying to detect the Tab key press in a TextBox I know that the Tab key does not trigger the KeyDown KeyUp or the K
  • 为什么 std::function 不是有效的模板参数,而函数指针却是?

    我已经定义了名为的类模板CallBackAtInit其唯一目的是在初始化时调用函数 构造函数 该函数在模板参数中指定 问题是模板不接受std function作为参数 但它们接受函数指针 为什么 这是我的代码 include
  • D3 向对象添加超链接?

    我正在尝试制作 D3 图 它将代表我网站的菜单 我尝试按照此处的其他指南添加超链接 但它们都不起作用 每个对象都会有一个不同的 URL 指向 主页 关于 联系方式等 如果添加超链接 我可以拖动对象吗 这意味着如果我按住单击 如果我单击该对象
  • ASP.NET MVC Server.MapPath 在 Internet Explorer 中提供完整路径

    我正在上传文件 var filename Server MapPath Path Combine Content UserContent Path ChangeExtension newName Path GetExtension atta
  • 我需要安装什么才能获取 Microsoft.TeamFoundation.WorkItemTracking.Client.dll?

    我只需要安装VS2010 SDK http www microsoft com downloads en details aspx FamilyID 47305cf4 2bea 43c0 91cd 1b853602dcc5 是否有 TFS2
  • 这个套利机器人真的能正常运行吗?

    我一直在研究创建某种形式的加密货币套利交易机器人 最近看到了以下视频 该视频展示了一个套利机器人 该机器人通过部署到币安智能链的智能合约上的单个函数调用来运行 我已经查看了合约的代码 但不确定它是否能真正发挥作用 或者它是否是一个骗局合约
  • 无法获取本地或参数的值,因为它在此指令指针处不可用,可能是因为它已被优化掉

    Visual Studio 2010 会删除 没有其他词 不安全块中函数参数之一中的数据 什么可能导致此错误 调试器显示以下消息 Cannot obtain value of local or argument as it is not a
  • 如何增加ofstream的缓冲区大小

    我想增加 C 程序的缓冲区大小 以便它不会过于频繁地写入 默认缓冲区是 8192 字节 我尝试使用 pubsetbuf 将其增加到 200K 原始代码 ofstream fq fastq1 cstr ios out fastq1 is a