抑制 R 中的错​​误消息

2024-05-14

我正在 R 中运行模拟研究。有时,我的模拟研究会产生错误消息。当我在函数中实现模拟研究时,当出现此错误消息时模拟停止。我知道抑制错误是不好的做法,但此时对我来说,除了抑制错误然后继续下一个模拟,直到达到我喜欢运行的模拟总数为止,没有其他选择。为此,我必须抑制 R 产生的错误消息。

为此,我尝试了不同的方法:

library(base64)
suppressWarnings
suppressMessages
options(error = expression(NULL))

在前两个选项中,仅抑制警告和消息,因此没有任何帮助。如果我理解正确的话,在最后一种情况下,应该避免所有错误消息。然而,这并没有帮助,该函数仍然停止并显示错误消息。

有人知道为什么这不能按我期望的方式工作吗?我在网上搜索了解决方案,但只能找到上述方法。 在我运行模拟的函数中,外部程序 JAGS(吉布斯采样器)分析了部分代码,并通过该分析产生了错误消息。这可能是哪里出了问题吗?

请注意,我不必抑制某个/特定的错误消息,因为没有生成其他错误消息,因此有一个仅抑制所有错误消息的选项“足够好”。

感谢您的时间和帮助!


正如之前的解决方案所建议的,您可以使用try or tryCatch函数,它将封装错误(更多信息在高级R http://adv-r.had.co.nz/Exceptions-Debugging.html)。但是,他们不会抑制错误报告消息stderr默认情况下。

这可以通过设置它们的参数来实现。为了try, set silent=TRUE. For tryCatch set error=function(e){}.

例子:

o <- try(1 + "a")
>  Error in 1 + "a" : non-numeric argument to binary operator
o <- try(1 + "a", silent=TRUE)  # no error printed

o <- tryCatch(1 + "a")
> Error in 1 + "a" : non-numeric argument to binary operator
o <- tryCatch(1 + "a", error=function(e){})
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