R 未获取用户库

2024-05-11

我有一个带 R 3.6.0 的 Fedora 30 系统,用户库设置在Renviron就像这个:

R_LIBS_USER=${R_LIBS_USER-'~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6'}

事实上,它出现在交互式 R 会话中:

> Sys.getenv('R_LIBS_USER')
[1] "~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6"

> .libPaths()
[1] "/home/mu/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.6"
[2] "/usr/lib64/R/library"                          
[3] "/usr/share/R/library"     

> .Library
[1] "/usr/lib64/R/library"

> .Library.site
[1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library"

但我还有一个 Debian 10 系统/etc/Renviron我有几乎完全相同的行:

R_LIBS_USER=${R_LIBS_USER-'~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5'}

但它没有显示在我的库搜索路径上,尽管环境变量在那里:

> Sys.getenv('R_LIBS_USER')
[1] "~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5"

> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"      
[3] "/usr/lib/R/library"           

> .Library
[1] "/usr/lib/R/library"

> .Library.site
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"      
[3] "/usr/lib/R/library"

当我安装软件包时,它还建议安装到该库中,但随后它找不到它们并崩溃,请参阅这另一个问题 https://stackoverflow.com/questions/57647120/r-cran-package-installation-failing。该目录还缺少什么才能使其进入库路径?


如果你有一个~/.Renviron,它可能会覆盖一些东西。如果你有一个~/.Rprofile它会调用.libPaths如果目录不存在,您的搜索路径中将没有它们。

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