Conda 将一个环境.yml 导入另一个环境

考虑将具有依赖项的 Python 子模块导入到具有其自己的依赖项的项目中的情况。假设子模块有它的environment.yml文件和项目本身有一个environment.yml file.

有没有办法创建一个包含这两种环境规范的环境？如果是的话，您将如何去做？ （或者有更好/更优选的方法来处理这种情况吗？）

我猜您是开发子模块和项目的人，因为依赖项仍然在environment.yml files.

选项 1：使用子模块的environment.yml 更新项目环境

不幸的是，如果您的子模块依赖于conda包。

# First create the project environment
$ conda env create --force -f project_environment.yml

# Then update with submodule dependencies
$ conda env update -n project-env-name --file submodule_environment.yml

这不太理想，因为基本期望是您导入的库具有自己的依赖项。

选项 2：将依赖项放入各自的requirements.txt 文件中

仅当子模块依赖项可以通过 PyPi 安装时才适用pip。首先将项目和子模块的依赖放入各自的requirements.txt files.

然后重构environment.yml文件查看以下内容：

submodule_environment.yml

name: submodule-env-name
channels:
  - defaults
dependencies:
- python=3.6.3             # no conda dependencies
- pip:
    - -r requirements.txt  # <--- submodule dependencies

project_environment.yml

name: project-env-name
channels:
  - defaults
dependencies:
- python=3.6.3
- pip:
    - -r requirements.txt                    # <--- project dependencies
    - -r project/submodule/requirements.txt  # <--- submodule dependencies

这样你就可以忽略submodule_environment.yml一起创建文件，然后使用单个命令创建项目环境。

$ conda env create --force -f project_environment.yml

如果您的submodule依赖于conda包。如果是这样，那么选项 1 是您的最佳选择。

选项 3：打包子模块（理想）

假设子模块没有 conda 依赖项，那么最好从子模块中创建一个单独的包。创建一个setup.py并将所有依赖项放入install_requires场地。这是一个模板，说明了如何setup.py https://gist.github.com/nitred/0764bfd72087946cab7c477395b24734#file-template_setup-py文件应该看起来像。

打包后，您可以执行以下操作：

• Install it locally using:
  • pip install .
• Upload to github or bitbucket and install it using:
  • pip install git+https://github.com/username/submodule.git --upgrade
• Upload to github or bitbucket and add the following to requirements.txt or environment.yml under pip:
  • git+https://github.com/username/submodule.git#egg=submodule