R barplot Y轴刻度太短

我正在尝试生成条形图，但 y 轴刻度太短。这是我的代码：

barplot(as.matrix(dat), log="y", ylim=c(10000,100000000), beside=TRUE,
        ylab = "Number of reads", col = c("gray","black","white"))

它为轴留下了空间（按照 ylim），但不填充实际轴。我已经经历过?barplot并尝试了一些事情（通过谷歌搜索我认为xpd = F, yaxs = c(10000,10000000,5)应该有效，但没有）。

我知道这是一件小事，但这正是我多年来一直困扰的问题，而不是实际工作，所以任何帮助将不胜感激！

编辑： 为输入的家伙干杯！

I did initially plot without ylim, but it ends up with an even more bizarre axis (with the same problem); I actually picked my ylim values to give it a nicer spaced axis.

这是数据：

dat <- read.table(text="D2,D3n,D3m,D4n,D4m
21234722,34262282,31920464,25486357,20712943
35343,64403,22537,39934,46547
126646,312286,101105,81537,76944", header=TRUE, sep=",")

编辑2： @DWin 说得对 - 我更新了我的 R，现在它绘制得很好 - 谢谢大家！

我看到你尝试设置ylim但你给出了不好的价值观。这将改变绘图的比例（如缩放）。例如看这个：

par(mfrow=c(2,1))
tN <- table(Ni <- stats::rpois(100, lambda = 5))
r <- barplot(tN, col = rainbow(20),ylim=c(0,50),main='long y-axis')
r <- barplot(tN, col = rainbow(20),main='short y axis')

Another option is to plot without axes and set them manually using axis and usr:

require(grDevices) # for colours
par(mfrow=c(1,1))
r <- barplot(tN, col = rainbow(20),main='short y axis',ann=FALSE,axes=FALSE)
usr <- par("usr")
par(usr=c(usr[1:2], 0, 20))
axis(2,at=seq(0,20,5))