Rstudio 中的 R 找不到 rmarkdown 包

2024-02-24

我第一次尝试在 PC 上的 Rstudio (0.98.953) 中使用 rmarkdown。我已升级到最新版本的 R (3.1.1) 和 R studio。本问题末尾提供了 sessionInfo() 的输出。

据我了解,rmarkdown 应该包含在 Rstudio 中。但是,当我选择在 Rstudio 中创建 Markdown 文档时,会弹出一个对话框,提示需要安装其他软件包。 rmarkdown 的安装总是失败,并显示以下消息:

Installing package into '\\cfsk18.campus.gla.ac.uk/SSD_Home_Data_X/jm383x/My        Documents/R/win-library/3.1'
(as 'lib' is unspecified)
* installing *source* package 'rmarkdown' ...
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
*** arch - i386
Warning in library(pkg_name, lib.loc = lib, character.only = TRUE, logical.return =     TRUE) :
  there is no package called 'rmarkdown'
Error: loading failed
Execution halted
*** arch - x64
Warning in library(pkg_name, lib.loc = lib, character.only = TRUE, logical.return =     TRUE) :
  there is no package called 'rmarkdown'
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed for 'i386', 'x64'
* removing '\\cfsk18.campus.gla.ac.uk/SSD_Home_Data_X/jm383x/My Documents/R/win-    library/3.1/rmarkdown'
Warning messages:
1: running command '"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "\\cfsk18.campus.gla.ac.uk\SSD_Home_Data_X\jm383x\My Documents\R\win-library\3.1"     "C:/PROGRA~1/RStudio/R/packages/rmarkdown_0.2.49_047a80058bb4ef0b142196013d1c4dd8870d4dd9.tar.gz"' had status 1 
2: In utils::install.packages("C:/Program     Files/RStudio/R/packages/rmarkdown_0.2.49_047a80058bb4ef0b142196013d1c4dd8870d4dd9.tar.gz",      :
  installation of package     'C:/PROGRA~1/RStudio/R/packages/rmarkdown_0.2.49_047a80058bb4ef0b142196013d1c4dd8870d4dd9.tar.gz' had non-zero exit status

我认为这与在我的工作场所使用托管桌面有关。然而,这通常不是问题,因为对这些机器的限制比通常情况要少得多,并且所有其他软件包、软件等都可以正常工作。

我也尝试过直接从 github 安装 rmarkdown 。同样,安装程序无法识别包 rmarkdown 本身。

导致错误的可能原因是什么?

会话信息输出:

R version 3.1.1 (2014-07-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United Kingdom.1252  LC_CTYPE=English_United Kingdom.1252        LC_MONETARY=English_United Kingdom.1252
[4] LC_NUMERIC=C                            LC_TIME=English_United Kingdom.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.1.1

尝试直接从 github 存储库安装:

devtools::install_github("rstudio/rmarkdown")
Installing github repo rmarkdown/master from rstudio
Downloading master.zip from https://github.com/rstudio/rmarkdown/archive/master.zip
Installing package from C:\Users\jm383x\AppData\Local\Temp\RtmpINmLRv/master.zip
Installing rmarkdown
Installing dependencies for rmarkdown:
httpuv
Installing package into ‘\\cfsk18.campus.gla.ac.uk/SSD_Home_Data_X/jm383x/My     Documents/R/win-library/3.1’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.1/httpuv_1.3.0.zip'
Content type 'application/zip' length 857357 bytes (837 Kb)
opened URL
downloaded 837 Kb

package ‘httpuv’ successfully unpacked and MD5 sums checked

The downloaded binary packages are in
    C:\Users\jm383x\AppData\Local\Temp\RtmpINmLRv\downloaded_packages
"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/bin/x64/R" --vanilla CMD INSTALL  \
  "C:\Users\jm383x\AppData\Local\Temp\RtmpINmLRv\devtoolscec10833677\rmarkdown-master"       \
  --library="\\cfsk18.campus.gla.ac.uk/SSD_Home_Data_X/jm383x/My Documents/R/win-   library/3.1" --install-tests 

* installing *source* package 'rmarkdown' ...
** R
** inst
** tests
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
*** arch - i386
    Warning in library(pkg_name, lib.loc = lib, character.only = TRUE, logical.return =     TRUE) :
      there is no package called 'rmarkdown'
    Error: loading failed
    Execution halted
    *** arch - x64
     Warning in library(pkg_name, lib.loc = lib, character.only = TRUE, logical.return = TRUE) :
  there is no package called 'rmarkdown'
    Error: loading failed
    Execution halted
    ERROR: loading failed for 'i386', 'x64'
* removing '\\cfsk18.campus.gla.ac.uk/SSD_Home_Data_X/jm383x/My Documents/R/win-      library/3.1/rmarkdown'

尝试运行此代码以获取最新版本的 rmarkdown 包,这应该可以解决问题:

install.packages("rmarkdown", repos = "https://cran.revolutionanalytics.com")

问题是 RStudio IDE 会查看在更新 rmarkdown 包之前拍摄的静态 CRAN 快照。欲了解更多信息,请参阅此链接:https://groups.google.com/forum/#!topic/rropen/Kgg8z6FF40I https://groups.google.com/forum/#!topic/rropen/Kgg8z6FF40I

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