将 fusionMatrix 的输出保存为 .csv 表

2024-02-09

我有以下代码产生类似表格的输出

 lvs <- c("normal", "abnormal")
 truth <- factor(rep(lvs, times = c(86, 258)),
                 levels = rev(lvs))
 pred <- factor(
                c(
                  rep(lvs, times = c(54, 32)),
                  rep(lvs, times = c(27, 231))),               
                levels = rev(lvs))

 xtab <- table(pred, truth)

 library(caret)
 confusionMatrix(xtab)

 confusionMatrix(pred, truth)
 confusionMatrix(xtab, prevalence = 0.25)   

我想将输出的以下部分导出为.csv table

               Accuracy : 0.8285          
                 95% CI : (0.7844, 0.8668)
    No Information Rate : 0.75            
    P-Value [Acc > NIR] : 0.0003097       

                  Kappa : 0.5336          
 Mcnemar's Test P-Value : 0.6025370       

            Sensitivity : 0.8953          
            Specificity : 0.6279          
         Pos Pred Value : 0.8783          
         Neg Pred Value : 0.6667          
             Prevalence : 0.7500          
         Detection Rate : 0.6715          
   Detection Prevalence : 0.7645          
      Balanced Accuracy : 0.7616  

尝试将其写为.csv表结果出现错误消息:

write.csv(confusionMatrix(xtab),file="file.csv")
Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE, stringsAsFactors = stringsAsFactors) : 
cannot coerce class ""confusionMatrix"" to a data.frame

由于显而易见的原因,手动完成整个工作是不切实际的,并且容易出现人为错误。

有关如何将其导出为.csv?


使用插入符包

results <- confusionMatrix(pred, truth)

as.table(results) gives

         Reference
Prediction  X1  X0
        X1  36  29
        X0 218 727

as.matrix(results,what="overall") gives

Accuracy       7.554455e-01
Kappa          1.372895e-01
AccuracyLower  7.277208e-01
AccuracyUpper  7.816725e-01
AccuracyNull   7.485149e-01
AccuracyPValue 3.203599e-01
McnemarPValue  5.608817e-33

as.matrix(results, what = "classes") gives

Sensitivity          0.8953488
Specificity          0.6279070
Pos Pred Value       0.8783270
Neg Pred Value       0.6666667
Precision            0.8783270
Recall               0.8953488
F1                   0.8867562
Prevalence           0.7500000
Detection Rate       0.6715116
Detection Prevalence 0.7645349
Balanced Accuracy    0.7616279

使用这些和 write.csv 命令,您可以获得整个混淆矩阵信息

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