在R中使用geom_line时显示不正确

给定一个数据框如下：

v1     v2     v3     v4
Tom     A     Jim     B
Gary    A     Shirly  A
Shirly  B     Jack    B
Tom     A     Jack    B
...

v2和v4分别表示v1和v3中的名称属于哪个组。汤姆属于 A 组，吉姆属于 v4 组。 我想绘制一个社交网络geom_net，如果两个名称位于同一行，则行链接到两个名称，例如，Tom and Jim。并且边的大小应该与它们在V3中出现的次数成正比，即Jack应该是两倍大Jim and Shirly.

I tried

ggplot(df, aes(from_id = V1,to_id = V3)) +geom_net()

But a very bad result is given:

并生成警告：

In f(..., self = self) :
There are 35 nodes without node information:
#And the below are all the values in V1 and V3
Tom, Shirly, ....
Did you use all=T in merge?

我想知道如何在没有x轴或y轴的情况下以正确且美观的方式显示结果，并且应清楚地显示边缘之间的关系。边缘的颜色应该代表它们所属的组。这意味着同一组中的所有名称应具有相同的颜色。

希望得到您的帮助！提前致谢！

我也为此苦苦挣扎，直到我弄清楚 geom_net 包的正确 data.frame 结构是什么。基本上，您需要的是一个包含两部分的 data.frame：在第 1 部分中，您通过提供 FROM 和 TO 列来描述边缘（绘制的线）。或者，可以在单独的列中提供附加信息，例如线宽

ans <- read.table(text ="
from to linewidth
Tom Jim 0.1
Gary Shirly 1
Shirly Jack 0.5
Tom Jack 2
", sep = " ", stringsAsFactors = FALSE, header=TRUE)

p <- ggplot(data = ans, aes(from_id = from, to_id = to))
p + geom_net(label = TRUE, vjust=-1)

但您会注意到某些节点（顶点）没有标记。所以这就是 data.frame 的第 2 部分很重要的地方。在第 2 部分中，您提供要标记的节点的名称。这是因为 geom_net 仅标记 FROM 节点而不是 TO 节点，因此您至少需要提供不用作 FROM 点的节点的名称。

ans <- read.table(text ="
from to linewidth
Tom Jim 0.1
Gary Shirly 1
Shirly Jack 0.5
Tom Jack 2
Helen Jack 3
Jim NA NA
Jack NA NA
", sep = " ", stringsAsFactors = FALSE, header=TRUE, na.strings = "NA")

p <- ggplot(data = ans, aes(from_id = from, to_id = to, linewidth = linewidth))
p + geom_net(label = TRUE, vjust=-1)

上面发生的几件事：1）我添加了“Jim NA NA Jack NA NA”作为未标记节点的标签，2）还添加了 na.strings =“NA”以确保 read.table() 正确解释 NA 值， 3）我将线宽参数添加到 aes 中，以便它从 data.frame 映射到绘图。

此外，一旦您提供了所有节点的名称，警告消息“有 XX 个节点没有节点信息”就会消失。

Hope that helps edit: as requested I added the resultant output. Since geom_net() changes the layout each time it is run, I have included two example images

为了完成整个 data.frame 构建过程，我在下面介绍了一种情况，其中您有两个单独的 data.frame，并且需要将它们合并在一起：第一个 data.frame 用于线（边缘），第二个是节点（顶点）。

lines <- read.table(text ="
from to linewidth
Tom Ivy 0.1
Gary Ivy 1
Shirly Ivy 0.5
Tom Helen 2
Helen Ivy 3
", sep = " ", stringsAsFactors = FALSE, header=TRUE, na.strings = "NA")

nodes <- read.table(text ="
name
Tom
Jim
Gary
Shirly
Jack
Helen
Susan
Joel
Ivy
", sep = " ", stringsAsFactors = FALSE, header=TRUE,na.strings = "NA")

df <- merge(lines, nodes, by.x = "from", by.y = "name", all = TRUE)

p <- ggplot(data = df, aes(from_id = from, to_id = to, linewidth = linewidth))
p + geom_net(label = TRUE, vjust=-1)