在 ggbiplot 中指定箭头（线段）的颜色、透明度和位置

我正在使用多变量数据创建 PCA 双标图。

有没有办法指定线段的颜色/透明度/位置ggbiplot？此命令的所有参数均不提供此选项。

I know ggbiplot是基于ggplot- 它也许接受吗aes论据？或者可以在创建的绘图上添加一层颜色/透明度/位置来覆盖默认值吗？

具体来说，关于位置，如果可能的话，我想抖动线段（尽管使它们更加透明可能已经解决了问题）。

工作示例，使用iris data:

#load required packages
library(ggplot2)
library(devtools)
library(ggbiplot)

#load dataset
data(iris)

#perform principal component analysis
pca = prcomp(iris[ , 1:4], scale=T)

#define classes, generate & view PCA biplot
class = iris$Species
ggbiplot(pca, obs.scale = 1, var.scale = 1, groups = class, circle = FALSE, 
         varname.size = 1, varname.adjust = 6)

非常感谢 - 感谢任何帮助！

亲切的问候。

看来你需要改变ggbiplot功能略。类型ggbiplot在控制台中，将代码复制到编辑器中。在里面arglist in the function，为箭头的颜色、线型和透明度（“alpha”）添加“名称 = 表达式”术语。

ggbiplot2 <- function (pcobj, choices = 1:2, scale = 1, pc.biplot = TRUE, 
          obs.scale = 1 - scale, var.scale = scale, groups = NULL, 
          ellipse = FALSE, ellipse.prob = 0.68, labels = NULL, labels.size = 3, 
          alpha = 1, var.axes = TRUE, circle = FALSE, circle.prob = 0.69, 
          varname.size = 3, varname.adjust = 1.5, varname.abbrev = FALSE, 
          color = muted("red"), # <- add new arguments to the function
          linetype = "solid",
          alpha_arrow = 1) 

然后搜索geom_segment部分，并添加参数color, linetype and alpha:

g <- g + geom_segment(data = df.v, aes(x = 0, y = 0, xend = xvar, yend = yvar),
                      arrow = arrow(length = unit(1/2, "picas")),
                      color = color, linetype = linetype, alpha = alpha_arrow)

将编辑后的函数指定为新名称，例如ggbiplot2。尝试一下，设置箭头默认值以外的值：

ggbiplot2(pca, obs.scale = 1, var.scale = 1, groups = class, circle = F, varname.size = 1, varname.adjust = 6,
color = "blue", linetype = "dashed", alpha_arrow = 0.5) # <- use the new arguments