我有一个用于并行计算的 C 代码,用于编写gcc
,我想在集群上编译它,这显然使用icc
via mpicc
。将代码更正为icc
-friend好像太费时间了,所以我想问一下OpenMPI
to use gcc
反而。我没有该集群的管理员权限,而且我实际上希望不要弄乱原始配置。
如果无法设置,例如Makefile
,那么我希望可以编译OpenMPI
在我的主目录中,但我需要一些关于此后必须做什么的指导。你可以帮帮我吗?
UPDATE1
The Makefile
包含
CC = mpicc
CFLAGS += -DMPI
这是一些 OpenMPI 文件
$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
lrwxr-xr-x /usr/bin/mpicc -> opal_wrapper
-rwxr-xr-x /usr/bin/opal_wrapper
如果我可以为您提供更多信息,请告诉我。
UPDATE2
随着杰夫的帮助 https://stackoverflow.com/questions/3353119/how-to-force-openmpi-to-use-gcc-instead-of-icc-is-recompiling-openmpi-necessary/3353941#3353941,我能够找到OpenMPI
设置为mpicc
$ more /usr/local/share/openmpi/mpicc-wrapper-data.txt
project=Open MPI
project_short=OMPI
version=1.1.4
language=C
compiler_env=CC
compiler_flags_env=CFLAGS
compiler=icc
extra_includes= openmpi
preprocessor_flags=
compiler_flags=-pthread
linker_flags=
libs=-lmpi -lorte -lopal -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -lutil -ldl
required_file=
但是,我无权编辑此文件,并且OPMI_CC = gcc
不改变编译器。
UPDATE3
环境变量CC = gcc
没有帮助
$ export CC=gcc
$ echo $CC
gcc
$ make clean $$ make
...icc:...errors
UPDATE4
...but export OMPI_CC=gcc
最终有帮助(感谢夏斯 https://stackoverflow.com/questions/3353119/how-to-force-openmpi-to-use-gcc-instead-of-icc-is-recompiling-openmpi-necessary/3353285#3353285)。有一天我应该记住这些是不同的事情......
尽管创建了二进制文件,我还是收到了以下再见消息
/opt/intel/fce/9.1.036/lib/libimf.so: warning: warning: feupdateenv is not implemented and will always fail