如何使用另一个测试结果中的标签来标记 ggplot 中的条形图?

2024-01-01

我想用测试的标签输出来标记我的图,例如,使用 agricolae 库中的 LSD.test 进行 LSD 测试输出(a、b、ab 等)。这是运行的示例。

library(ggplot2) 
library(agricolae)
wt<-gl(3,4,108,labels=c("W30","W60","W90")) 
pl<-gl(3,12,108,labels=c("P0","P1","P2")) 
gp<-gl(3,36,108,labels=c("A","B","C")) 

dat<-cbind(
  A=runif(108),
  B=runif(108,min=1,max=10),
  C=runif(108,min=100,max=200),
  D=runif(108,min=1000,max=1500)
) 
dat.df<-data.frame(wt,pl,gp,dat) 
dat.m<-melt(dat.df) 

ggplot(dat.m,aes(x=wt,y=value,group=pl,facet=gp,fill=pl))+         
  stat_summary(fun.y=mean,geom="bar",size=2,position="dodge")+         
  stat_summary(fun.ymin=function(x)(mean(x)-sd(x)/sqrt(length(x))),geom="errorbar", 
  fun.ymax=function(x)(mean(x)+sd(x)/sqrt(length(x))),position="dodge")+
  facet_grid(variable~facet,scale="free_y")+ 
  opts(legend.position="top")+                      
  scale_colour_manual(values = c("red", "blue", "green"))

通常,在其他库中,我测试数据,并将标签传递给文本图,但是可以在 ggplot 中做到这一点吗?例如,在 stat_summary() 中,使用 fun.y 中的 LSD.test ?


为了实现这一点,您必须使用创建另一个标签层geom_text并指定自己的数据集。

扩展中的示例lsd.test包装内agricolae:

library(agricolae)
library(ggplot2)

data(sweetpotato)
model <- aov(yield~virus, data=sweetpotato)
lsd <- LSD.test(model,"virus",p.adj="bon")

ggplot() + 
  stat_summary(data=sweetpotato, aes(x=virus, y=yield), fun.y=mean, geom="bar") +
  geom_text(data=lsd, aes(x=trt, y=means, label=round(means, 1)), vjust=0)
本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

如何使用另一个测试结果中的标签来标记 ggplot 中的条形图? 的相关文章

  • 从 R 中的向量中选择所有可能的元组

    我正在尝试用 R 编写一个程序 当给定一个向量时 将返回所有可能的tuples http en wikipedia org wiki Tuples该向量中的元素 例如 元组 c a b c c a b c 出租车 c a c c b c c
  • 基于另一个数据集获取数据集的子集

    假设我有一个数据集 即 dat1 ID block plot SPID TotHeight 1 1 1 4 44 5 2 1 1 4 51 3 1 1 4 28 7 4 1 1 4 24 5 5 1 1 4 27 3 6 1 1 4 20
  • R 中具有稳健回归的异常值

    我正在使用lmrobR 中的函数使用robustbase用于稳健回归的库 我会把它用作 rob reg lt lmrob y 0 dat method MM control a1 当我想返回我使用的摘要时summary rob reg 稳健
  • 计算例如具有多列 data.frames 的列表中的平均值

    我有几个 data frames 的列表 每个 data frame 有几列 通过使用mean mylist first dataframe a我可以得到这个 data frame 中 a 的平均值 但是我不知道如何计算列表中存储的所有 d
  • 如何在 ggplot 中保持配色方案,同时删除每个图中未使用的级别?

    我想比较一个图中的数据的一些子组和另一图中的一些其他子组 如果我绘制一个图 其中绘制了所有子组 那么这个数字将是巨大的 并且每个单独的比较都会变得困难 我认为如果给定的子组在所有图中都具有相同的颜色 这对读者来说会更有意义 这是我尝试过的两
  • LDA with topicmodels,如何查看不同文档属于哪些主题?

    我正在使用 topicmodels 包中的 LDA 我已经在大约 30 000 个文档上运行它 获取了 30 个主题 并获得了主题的前 10 个单词 它们看起来非常好 但我想看看哪些文档属于哪个主题的概率最高 我该怎么做 myCorpus
  • numpy.histogram 的 hist 维度,密度 = True

    假设我有这个数组 A array 0 0019879 0 00172861 0 00527226 0 00639585 0 00242005 0 00717373 0 00371651 0 00164218 0 00034572 0 008
  • 使用 broom 和 tidyverse 总结 r 平方游戏

    我发布了一个问题here https stackoverflow com questions 48627287 getting adjusted r squared value for each line in a geom smooth
  • 计算每个唯一值出现的次数

    假设我有 v rep c 1 2 2 2 25 现在 我想计算每个唯一值出现的次数 unique v 返回唯一值是什么 但不返回它们的数量 gt unique v 1 1 2 我想要一些能给我的东西 length v v 1 1 25 le
  • 在shiny中过滤传单地图数据

    我在用传单地图设置这个闪亮的东西时遇到了麻烦 我的原帖 https stackoverflow com questions 50111566 applying leaflet map bounds to filter data within
  • R中的一元加/减是什么?

    来自 R 的详细信息部分Syntax http stat ethz ch R manual R patched library base html Syntax html帮助页面 定义了以下一元和二元运算符 他们被列出 在优先级组中 从最高
  • 我无法下载 R 中的 reshape2 包 [关闭]

    Closed 这个问题是无法重现或由拼写错误引起 help closed questions 目前不接受答案 我在尝试安装 R 包时收到此响应 gt installed packages reshape2 Package LibPath V
  • 纵向序列数据的三次样条方法?

    我有一个串行数据 格式如下 time milk Animal ID 30 25 6 1 31 27 2 1 32 24 4 1 33 17 4 1 34 33 6 1 35 25 4 1 33 29 4 2 34 25 4 2 35 24
  • 多功能测试仪替代 system.time

    我已经看到 我认为是这样 使用了类似于 system time 的函数 它可以同时评估多个函数的时间并输出一个输出 我不记得它是什么 并且用我正在使用的术语进行互联网搜索并没有得到我想要的响应 有人知道我正在谈论的功能的名称 位置吗 你想要
  • 选择 R 中的数据表中隐藏时(在绿色加号下方)列的显示顺序

    Context 使用 DataTables 库制作交互式表格时 当屏幕宽度对于列的数量和宽度来说太窄时 列将隐藏在绿色 号下 我有一个非常宽的表格 有 20 多列 其中一些内容非常冗长 因此某些列在所有屏幕宽度下总是隐藏的 每次隐藏新列时
  • 如何使用 usmap 标记数字而不是名称?

    我知道 usmap 有一个选项label in plot usmap 我想标记一些数字 而不是状态名称 我想 usmap 中应该有与州质心坐标相关的数据 但我不知道如何找到它 如果我能得到 坐标然后我可以用它来标记数字geom text 这
  • 将绘图调用拆分为多个块

    我正在编写一个图的解释 其中我基本上将在第一个块中创建图 然后描述该输出 并在第二个块中添加一个轴 然而 似乎每个块都会强制一个新的绘图环境 因此当我们尝试使用以下命令运行块时会出现错误axis独自的 观察 output html docu
  • r 中训练和测试数据的最小最大缩放/归一化

    我正在创建一个函数 它将训练集和测试集作为其参数 最小 最大缩放 标准化并返回训练集并使用这些same最小值和最小 最大范围的值 标准化并返回测试集 到目前为止 这是我想出的功能 min max scaling lt function tr
  • ggplot2 geom_密度和geom_histogram在一个图中

    如何制作一个所有条形加起来为 1 的直方图 并在适合的上方添加一个密度层 set seed 1234 df lt data frame sex factor rep c F M each 200 weight round c rnorm 2
  • 旋转 Markdown 的表格 pdf 输出

    我想将 pdf 上的表格输出旋转 90 度 我正在使用 Markdown 生成报告并kable循环显示表格 如果可以的话我想继续使用kable因为还有很多其他依赖于它的东西我没有包含在这个 MWE 中 这是一个简单的例子 使用iris数据集

随机推荐