我正在尝试通过使用 R 调用程序在 java 中使用 R 来实现集群。我正在尝试运行示例代码进行聚类验证，并且遇到大多数用户面临的常见错误：文件过早结束
package test;
import rcaller.RCaller;
import java.io.File;
import java.lang.*;
import java.util.*;
import java.awt.image.DataBuffer;
public class test3 {
public static void main(String[] args) {
new test3();
}
public test3()
{
try{
RCaller caller = new RCaller();
caller.cleanRCode();
caller.setRscriptExecutable("C:/Program Files/R/R-2.15.1/bin/x64/Rscript");
caller.cleanRCode();
caller.addRCode("library(clvalid)");
caller.addRCode("data(mouse)");
caller.addRCode("express <- mouse [,c(M1,M2,M3,NC1,NC2,NC3)]");
caller.addRCode("rownames (express) <- mouse$ID ");
caller.addRCode("intern <- clValid(express, 2:6 , clMethods = c( hierarchical,kmeans,diana,clara,model) ,validation = internal)");
caller.addRCode("b <- summary(intern) ");
caller.runAndReturnResult("b");
}
catch (Exception e){
e.printStackTrace();
}
}
}
您的代码中有一些拼写错误。喜欢clValid不是 clvalid ，并且您会错过许多引用，例如“hierarchical”，....
我认为最好将代码放在脚本中，然后从 java 中调用它，如下所示：
Runtime.getRuntime().exec("Rscript myScript.R");
其中 myScript.R 是：
library(clValid)
data(mouse)
express <- mouse [,c('M1','M2','M3','NC1','NC2','NC3')]
rownames (express) <- mouse$ID
intern <- clValid(express, 2:6 , clMethods = c( 'hierarchical','kmeans',
'diana','clara','model') ,
validation = 'internal')
b <- summary(intern)
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