为 R 中所有列的多行创建摘要(第 90 个百分位)统计数据的新数据框

2023-12-03

我正在开展一个学校项目,有一个包含 4,000 行的数据集。有 40 名参与者,每人大约有 100 行。我想创建一个数据集,将每个参与者的行折叠成汇总统计数据,最好是第 90 个百分位。我知道如何用 dplyr 找到平均值:

Means <- bladder %>% 
  group_by(id, group) %>% 
  summarise(across(everything(), list(mean)))

这效果很好。但我是否可以做同样的事情,但列出第 90 个百分位数而不是均值?

谢谢你!!


R中计算百分位数的函数是quantile。我们可以指定probs = 0.9获得第 90 个百分位。

这里我使用的是bladder数据集来自survival包来演示。

library(dplyr)

survival::bladder %>% 
  group_by(id, rx) %>% 
  summarize(across(everything(), quantile, probs = 0.9, .groups = "drop"))

# A tibble: 85 × 7
      id    rx number  size  stop event  enum
   <int> <dbl>  <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
 1     1     1      1     3     1   0     3.7
 2     2     1      2     1     4   0     3.7
 3     3     1      1     1     7   0     3.7
 4     4     1      5     1    10   0     3.7
 5     5     1      4     1    10   0.7   3.7
 6     6     1      1     1    14   0     3.7
 7     7     1      1     1    18   0     3.7
 8     8     1      1     3    18   0.7   3.7
 9     9     1      1     1    18   1     3.7
10    10     1      3     3    23   0     3.7
# … with 75 more rows
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