问题是如何在不知道边类型的情况下使用 sparql 查询计算三重存储 (RDF) 中两个节点(概念)之间的距离。本质上,就是使用Dijkstras_algorithm
找到三重存储中两个概念之间的较短路径。
如果我们知道边的类型,就有可能:计算节点之间的路径长度?
另一种解决方案是使用类距离(如果概念没有从主类扩展,则不起作用):测量 RDF/OWL 图中类之间的距离
Example:
找出之间最短的距离http://bioinformatics.ua.pt/coeus/resource/uniprot_P01008 and http://bioinformatics.ua.pt/coeus/resource/go_GO:0005576
您可以使用与计算节点之间的路径长度?,但您需要使用通配符而不是特定属性。图案(<>|!<>)
是一个通配符,因为每个属性都是<>
或者它不是。你也可以使用(:|!:)
,但这只有在你有一个:
已定义前缀。(<>|!<>)
永远会起作用。这是一个例子:
@prefix : <urn:ex:>
:a :p :b .
:b :q :c .
:c :r :d .
:d :s :e .
prefix : <urn:ex:>
select ?start ?end (count(?mid) as ?length) {
?start (<>|!<>)* ?mid .
?mid (<>|!<>)+ ?end .
}
group by ?start ?end
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| start | end | length |
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| :a | :b | 1 |
| :a | :c | 2 |
| :a | :d | 3 |
| :a | :e | 4 |
| :b | :c | 1 |
| :b | :d | 2 |
| :b | :e | 3 |
| :c | :d | 1 |
| :c | :e | 2 |
| :d | :e | 1 |
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