我正在尝试将 hdf5 加载到 R 中并遇到一些问题。以下是我配置环境所采取的步骤：
- Mac OS X 10.6 上的 R 2.10.0 (x64)
- 通过 macports 安装 hdf5 1.8.3
- 来自 CRAN 的 hdf5_1.6.9.tar.gz
我怀疑我遇到的问题与我的 HDF5 版本和 R 模块期望的版本不兼容有关。为了完整起见，以下是我安装 R 模块的方式：
R CMD安装 --configure-vars='CPPFLAGS=-I/opt/local/include' --configure-args='--with-hdf5=/opt/local' hdf5_1.6.9.tar.gz
这构建得很好。该库似乎加载没有问题，但当我尝试加载文件时没有返回数据：
库（hdf5）
hdf5load("测试.h5")
NULL
Yet,
osx:数据 scott$ h5dump test.h5
HDF5“测试.h5”{
团体 ”/” {
数据集“dset”{
数据类型 H5T_STD_I32LE
简单数据空间 { ( 31 ) / ( 31 ) }
数据 {
(0)：1、2、4、8、16、32、64、128、256、512、1024、2048、4096、8192、
（14）：16384、32768、65536、131072、262144、524288、1048576、2097152、
(22): 4194304、8388608、16777216、33554432、67108864、134217728、
(28): 268435456、536870912、1073741824
}
}
}
}
有什么想法吗？
提前致谢。
您还可以尝试 CRAN 上的 h5r 包。该软件包使用新的 hdf5 库，并提供比 hdf5 库更多的功能。
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