使用 zcat 和 sed 或 awk 编辑压缩的 .gz 文本文件

我正在尝试编辑压缩的 fastq.gz 文本文件，通过删除第 2,6,10,14 行的前六个字符...我现在有两种不同的方法来执行此操作，使用 awk 或 sed，但这些仅如果文件被解压，似乎可以工作。我想编辑这些文件而不解压缩它们，并尝试了以下代码但没有让它工作。谢谢。

使用 sed：

zcat /dir/* | sed -i~ '2~4s/^.\{6\}//'

使用 awk：

zcat /dir/* | awk 'NR%4==2 {gsub(/^....../,"")} 1'

您无法绕过压缩，但可以以自动方式将解压缩/编辑/重新压缩链接在一起：

for f in /dir/*; do
  cp "$f" "$f~" &&   
  gzip -cd "$f~" | sed '2~4s/^.\{6\}//' | gzip > "$f"
done

如果您对操作很有信心，可以通过添加删除备份文件rm "$f~"到循环体的末尾。