程序员经验分享-hwhale

2021-05-03

2023-11-20

（一）R中安装“phyloseq”的方法  

    很多网上的教程使用的都是

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("phyloseq")

但是我尝试了很多次，最后还是没有成功！

下面能成功安装“phyloseq”的代码

library(BiocManager)
BiocManager::install("phyloseq")

-2021-5-3第一次尝试写，小白一个，以后继续加油！

本文内容由网友自发贡献，版权归原作者所有，本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容，请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

R语言

生物信息学

数据可视化

统计学

2021-05-03 的相关文章

  • R语言与机器学习中的回归方法学习笔记

    来源 http blog sina com cn s blog 62b37bfe0101hom5 html key word lars rpart randomForest cp svm data diabetes prune boosti

  • 三句话，我让R语言自动升级了

    R语言是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言 主要用于统计分析 绘图 数据挖掘 跟所有计算机语言一样 R语言也面临升级的问题 本文讲述了最快捷的升级R语言办法 不用重新安装之前的安装包 首先 进入R交互模式 然后三条命令搞定 instal

  • 生信技能树R语言学习

    一 数据类型和向量 1 数据类型 1 1 判断数据类型class 1 2 按Tab键自动补全 1 3 数据类型的判断和转换 1 is 族函数 判断 返回值为TRUE或FALSE is numeric 123 is character a i

  • ggplot2作图之系统发育树

    library ape tree lt read tree text A B C D E F G H I J K L M N O P library ggtree ggtree tree branch length none ladderi

  • 使用R语言中的survival包进行生存分析是一种常见的统计方法

    使用R语言中的survival包进行生存分析是一种常见的统计方法 在生存分析中 我们经常需要创建一个生存对象来存储事件发生时间和事件状态 在本文中 我们将介绍如何使用survival包中的Surv函数来创建生存对象 并解读其结果 Surv函

  • R语言实现文本情感分析

    在本博客中 我们将介绍如何使用R语言进行文本情感分析 我们将介绍如何处理文本数据 构建模型 训练模型并进行情感预测 这里我们将使用IMDb电影评论数据集进行示例分析 数据准备 首先 我们需要下载并加载IMDb电影评论数据集 可以从这里下载数

  • PCL 大窗口可视化两个点云

    一 主要参数 viewer gt setFullScreen true 设置点云为全屏显示的2D俯视图 二 代码实现 1 一个大窗口可视化两个点云 include

  • R语言聚类分析

    本文首发于公众号 医学和生信笔记 完美观看体验请至公众号查看本文 文章目录 系统聚类 层次聚类 Hierarchical clustering 快速聚类 划分聚类 partitioning clustering K means聚类 围绕中心

  • 使用lattice包的bwplot函数绘制箱图比较多个模型在不同指标上的性能差异（R语言）

    使用lattice包的bwplot函数绘制箱图比较多个模型在不同指标上的性能差异 R语言 箱图是一种常用的数据可视化方法 用于表示一组数据的分布特征 包括中位数 四分位数 异常值等 在比较多个模型在多个指标上的性能差异时 箱图可以提供直观的

  • 数字化转型中的国产化替代之路

    引言 数字经济浪潮席卷全球 我国数字经济已进入快速发展阶段 加快推进企业数字化转型 已成为共识 同时有利于构建全产业链数字化生态 增强产业链上下游的自主可控能力 为数字经济社会发展 构建数智化生态注入新动能 在此过程中 国产软件企业作为数字

  • [R语言] R语言PCA分析教程 Principal Component Methods in R

    R语言PCA分析教程 Principal Component Methods in R 代码下载 主成分分析Principal Component Methods PCA 允许我们总结和可视化包含由多个相互关联的定量变量描述的个体 观察的数

  • R-INLA Project目录

    集成嵌套拉普拉斯近似法 INLA 是一种近似贝叶斯推断的方法 在过去的几年里 由于其速度和通过R INLA软件包的易用性 它已经成为马尔科夫链蒙特卡洛等其他方法的替代品 尽管INLA方法的重点是可以表达为潜伏高斯马尔可夫随机场 GMRF 的

  • R语言读取Excel的神器——openxlsx

    作为非程序猿的各位同志们 可能最擅长的数据整理软件或者统计软件就是 嗯 没有错 它就是集万千宠爱于一身的E X O 咳咳咳 好了 隆重推出我们的主角 Excel 事实上 Excel是个super强大的软件 基本上用它已经能完成大量的统计分析

  • R语言与多元线性回归方程及各种检验

    R语言与多元线性回归方程及各种检验 文章目录 R语言与多元线性回归方程及各种检验 一 模型建立 二 多重共线性 1 产生的背景 2 多重共线性的检验 1 简单相关系数法 2 方差膨胀因子 vif 法 3 矩阵 X T X

  • 主成分分析R语言实现

    主成分分析是一种常见的降维统计方法 它通过适当的变量替换 使得新变量成为原变量的线性组合 并且新变量间彼此独立 从而可从错综复杂的关系中寻求主要成分信息 揭示变量内在关系 本次主要分享的是该方法的R语言实现 目录 数据集展示 一 计算相关系

  • EasyV不止可视化｜易知微带你打开可视化工具新大门！

    可视化工具的发展已经成为当今信息技术领域中的一股不可忽视的力量 如今 人们有了更多的数据和信息需要处理 因此需要一种更加高效 更加直观的手段来呈现这些信息 而可视化工具应运而生 这些工具包括多种类型的图表 地图 仪表板等 随着技术不断革新和

  • R语言——基本操作（一）

    目录 一 基本操作 二 R包的安装及使用 三 获取帮助 四 内置数据集 五 数据结构 六 向量索引 七 向量运算 参考 Rstudio 控制台常用快捷键 Ctrl 查看所有历史记录 比直接使用 查找更方便 Esc 中断操作 可中断未完成的操

  • R语言采集获取58商铺出租转让信息

    前两篇文章给我一个朋友分析出店铺商品以及地址房源信息 后来去看了下店铺房租有点贵 还是毛坯房 要自己装修 本着节约成本的原则 熬了个通宵 给他采集了一些转租商铺数据 因为数据比较多 过于先进不方便展示 我就将我爬虫程序的模版展示给大家观看

  • 数据工作者最爱的AI功能，你知道吗～

    在工作中难以避免的一项任务就是各种数据总结和汇报 怎么分析总结 以何种形式汇报 都是具有一定的难点 所以我要推荐的就是具有AI图表解析功能的可视化工具 Easyv数字孪生低代码可视化平台 可实现对数据的可视化展示 通过丰富的图表组件 清晰展

  • haiku定义简单的模型并初始化参数

    Haiku 是一个基于 JAX 的深度学习库 旨在提供简洁 灵活且易于使用的 API 以构建和训练神经网络模型 import haiku as hk import jax import jax numpy as jnp 1 定义简单的二层神

随机推荐

  • 讲解 最大流问题+最小花费问题+python(ortool库)实现

    文章目录 基本概念 图 邻接矩阵 最大流问题 python解决最大流问题 python解决最大流最小费用问题 喜欢的话请关注我们的微信公众号 你好世界炼丹师 公众号主要讲统计学 数据科学 机器学习 深度学习 以及一些参加Kaggle竞赛的经

  • ul里面可以放div吗？

    在HTML中 ul 标签代表无序列表 可以用来展示项目列表 而 div 标签则是div容器用于分组内容 提供独立于文档的CSS样式和JavaScript事件处理 那么 ul里面可以放div吗 答案是肯定的 下面从多个方面进行详细阐述 一 语

  • MacBook安装使用XMind

    MacBook安装使用XMind XMind简介 官方地址 https www xmind cn XMind 是一个全功能的思维导图和头脑风暴软件 为激发灵感和创意而生 作为一款有效提升工作和生活效率的生产力工具 受到全球百千万用户的青睐

  • 计算机内存插在主板的哪个槽,四个内存插槽，这是正确的安装顺序

    具有防呆设计的主板插槽几乎不可能错误地插入 因此很有可能在第一个插槽中安装了内存 尽管可以 但是会阻止内存在最佳状态下工作 主板手册中有这样一句话 说明 为便于理解 首先对内存插槽编号 从靠近CPU插槽的位置开始 主板 针对不同情况的最佳安

  • 区域生长算法及其实现

    区域生长算法及其实现 背景 前面我们已经介绍了 最大熵分割法 OTSU算法 他们都有各自的优缺点 通常都不是单独使用这些算法 需要和其它算法来结合使用 前面两类算法都是单独对图像的灰度信息进行处理 不包含图像的空间信息 而区域生长算法则包含

  • 云计算与大数据概论第十一周

    分布式计算 分布式计算是一种计算方法 和集中式计算是相对的 随着计算技术的发展 有些应用需要非常巨大的计算能力才能完成 如果采用集中式计算 需要耗费相当长的时间来完成 分布式计算将该应用分解成许多小的部分 分配给多台计算机进行处理 这样可以

  • 如何快速开发一个简单实用的MES系统？

    01 如何快速开发一个简单实用的MES系统 MES生产管理系统 又称制造执行系统 是一种集成了计划 生产 质量控制 库存管理和材料申请等生产流程的管理系统 是企业中实现高效生产的重要一环 根据题主描述 通过产品条形码实现对生产计划下的产品追

  • 小程序的基础（三）

    文章目录 前言 一 navigator 二 rich text 作用 1 nodes属性 注意 三 button open type 的 contact的实现流程 代码示例 1 contact 直接打开 客服对话功能 需要在微信小程序的后台

  • int argc，char*argv[ ]的简洁解释

    1 arguments argument counter 计数个数 和 argument vector 矢量 带有方向的变量参数 也就是指针 argc命令行输入参数的个数 int main int argc char argv int i

  • 【操作系统】王道考研 p42 段页式管理方式

    段页式管理方式 知识总览 分段 分页管理方式中最大的优缺点 关于段式管理会产生外部碎片 ps 分段管理中产生的外部碎片也可以用 紧凑 来解决 只是需要付出较大的时间代价 分段 分页 段页式管理 示意图 先分段 后分页 段页式管理的逻辑地址结

  • oracle 的路径不一致,DG环境搭建，在备库遇到问题，主备库的路径不一致

    现在在做oracle DG的环境搭建 因为实际生产的原因 主备库的路径是不一致的 我把主库的rman文件传到备库后 在备库进行恢复 无法恢复 求指导 oracle std bak rman target sys 123456 pri aux

  • java变量作用域和堆栈

    一 作用域决定了变量的可见性和生命周期 java中变量分为成员变量和局部变量 如下 1 成员变量 在类的所有方法外部声明的变量 即类所拥有的变量 可以被系统初始化 1 1静态成员变量 类被加载时被创建 其生命周期与该类的生命周期相同 1 2

  • 在自己的bash脚本中实现自动补全

    在90年代Linux和DOS共存的年代里 Linux的Shell们有一个最微不足道但也最实用的小功能 就是命令自动补全 而DOS那个笨蛋一直到死都没学会什么叫易用 Linux的这个微不足道的小传统一直延续至今 虽然看似微不足道 其实也极大的

  • stm32无法唤醒DTH11温湿度传感器解决

    关于DTH11的介绍和使用方法可以随便搜索一下别的文章 直接搜索DTH11即可 这里使用艾克姆科技的例程 却无法成功运行 上了示波器才发现拉低时间无法达到18ms 因此无法唤醒DTH11 总线由stm32拉低12ms左右之后就一直处于高电平

  • CString字符串查找和截取

    1 Find 该函数从左侧0索引开始 查找第一个出现的字符位置 CString str abc int postion str Find a 如果查到 返回以0索引起始的位置 未查到 返回 1 如果查到 返回以0索引起始的位置 未查到 返回

  • 卷积神经网络CNN小结（简单实现代码mnist数据集）

    由于全连接神经网络处理图像中的需要训练参数过多的问题 而卷积神经网络中 卷积层的神经元只与前一层的部分 神经元节点相连 既它的神经元的连接是非全连接的 且同一层某些神经元之间的连接的权重w和偏移b是共享的 这样大量减少了训练参数的数量 图1

  • 多线程事务怎么回滚？说用 @Transactional 可以回去等通知了！

    背景介绍 1 最近有一个大数据量插入的操作入库的业务场景 需要先做一些其他修改操作 然后在执行插入操作 由于插入数据可能会很多 用到多线程去拆分数据并行处理来提高响应时间 如果有一个线程执行失败 则全部回滚 2 在spring中可以使用 T

  • C++day4（关系运算符的重载）

    关系运算符重载的作用 可以让两个自定义类型对象进行对比操作 代码实现关系运算符的重载 include

  • unity工程崩溃资源找回

    1 Unity死机未保存场景 当你在Unity中编辑场景 突然死机时 可以在项目文件目录中找到Temp文件夹 双击文件夹 找到 Backupscenes文件夹 把后缀为 backup的文件后缀改为 unity 然后拖进Unity的Proje

  • 2021-05-03

    一 R中安装 phyloseq 的方法 很多网上的教程使用的都是 source https bioconductor org biocLite R biocLite phyloseq 但是我尝试了很多次 最后还是没有成功 下面能成功安装 p

热门标签